ＣＡＦＥ＆ＢＡＲ

マルドゥークの封印

ラビシジルの石版に封印された魔神マルドゥークが、偽典中では復活しないことが判明しました。この石版の封印は、偽典の続編で解ける予定だったようです。

魔震災

黄泉の大国主が主人公に説明していた「魔震災」とは、核ミサイルが東京で炸裂したあとに起きた大震災を意味します。これらを全部含めて「大破壊」と呼ばれております。

相馬三四郎の探しているキョウコ

相馬三四郎の探しているキョウコは、漫画版『真・女神転生』のキョウコと同一人物です。

代々木労働キャンプのキョウコ

代々木労働キャンプに囚われて洗脳された女性から「今まで何処に行ってたの？キョウコったら、とっても寂しかったのよ……」という独り言が聞けますが、この女性はキョウコ本人ではなく、相馬三四郎が探しているキョウコに関連する人として登場したことが判明しました。

代々木労働キャンプに捕まっているツチグモとオルトロス

シナリオの流れに深く関わっているイベントではないことが分かりました。なお、捕まっている詳しい事情については「登場悪魔紹介」のページを参照してください。

早坂の蘇生

条件については不明ですが、市ヶ谷シェルターに保存されている早坂の肉体は蘇り、英美と一緒に渋谷のほうへ向かうことが判明しました。なお、蘇生後にＰＣとして復帰することはありません。

樹海の正体

中有で出会う樹海という人物は、漫画版『真・女神転生』に登場する真言宗・吉祥寺の樹海和尚と同一人物です。

渋谷にあるとされる強力な武器

岳克美から「強い武器をお渡しする……」と云われますが、この武器を偽典中で受け取ることが不可能なことが判明しました。開発当初には、ガブリエルから強力な武器を授けられる予定があったようです。

主人公の胸にある十字傷

葛城には幼い頃、父親と一緒にいるときに悪魔に襲われた経験があり、この傷跡はそのときに悪魔につけられたものです。

イシュタルの槌で保護されている由宇香の母親

由宇香の母親は「利用価値有り」と考えた教団に狙われて洗脳された、という設定だったことが判明しました。

真のエンディング

基本的に九種類のものから成り立っているエンディングのうち、人間のままのエンディングが続編に繋がるエンディングだったようです。ですから、人間のままのエンディングが真のエンディングと呼べるかもしれません。ちなみに続編ではどちらかの女性とともに生き残り、それなりの勢力を持った存在として葛城は主人公たちの前に現われる予定だったようです。

女神転生エンディングでのイシュタルと月の関係

古代アッシリア及びバビロニアにおける神話のなかでは、イシュタルは月の神シンの娘と云われております。またイシュタル信仰となってエジプト、中東、ギリシアに広がった時代では、誕生と死（満月と新月））を支配する月の女神と見なされるようになったそうです。イシュタルと対応している古代フェニキアのアスタルテも、月に関係のある女神のようです。ちなみに古代フェニキア人は、アスタルテを雌牛の角を持ったものとして描いていたそうなので、ゲーム中におけるイシュタルに角があったのは、この影響のせいかもしれません。

主人公と別れたあとの相馬三四郎の行方

相馬三四郎は続編の中心人物として再登場させる予定があったようです。

ＤＢ入隊試験の武器庫

条件については不明ですが、銃を拾って犯人を撃つ（狙いがはずれると人質や壁に命中）ことができます。

由宇香と泪とのラブシーンについて

由宇香とのラブシーンが失敗に終わることがあるように、泪とのラブシーンも主人公が拒む（条件については不明）ことで失敗します。